Name: Solyc04g005320
(Exon Intron)
Length: 5048
AGTCGAGAAATGGTCCAAAATAGAAATGTATGTTTGACTTATTACATGACATATTTATATATATATCATTATAGTTTACTAAACATGCAAGCTAGTTAGTCTTTGAAACACAAAAAACTCAACTTGTATGTATGCAAGAAATTACATTTATTGGTTCTTAGTTTCCAATCTCAAACTTTCAACCACTTAATTGCTTGTTT
CCCATTCAAAGCATCCATCCTGGTAAAATTCCAGTAGCATTCTGTGTTGATGGTTCTATACTATCCAATGGAGCCACATTGTACCTGTACTTACATGAAC
TTCAGATTCTGAATTCGCCCCTACAACAACGCTCATCAAATACATTAAGAAATTAATTTGAATTGATCCATATATAATATACTTTCGTCTCTCGACTTCC
AACATAACTCGCTTTAGAAATTATTTTGAATGTATGTATTTAGTATTACTTTAGGTTTTGAATTCGTCTCAAACTTTACAAAACGACTCACTTCAATAAA
TACACAAAGAGATTGATTCGACTGTATCTATTACTTTAGATTCTAAATTCACCTCTAGACTTACGACTTGACTCACTTCGATAAATACACAAAGAAATTA
ATTTGAATGTATCTGTTACTTCAGATTCTGAATTCACCTCTCAACGACTCAATTCAACGGTTCAATTTAAAATGTTGCAAAAAATATGCTATTTAAAGGA
AAAAAAGAAAACATAAAATTATATGTTACCTGTTTGGCACTATATTAGTATTGCATTGTAAAGGCTGAAAGAACCCCTCTGACTGAGCAGGTTGTTGTCT
GAATTGTACATTTTGCTCTCCAGTGATATGCCAATGTGCTACAGAGTTTTCTTCCAACTATTATAAGAATTTCATAAAATCGCGTAAAAAGTACGATAAG
TTAGACATCAAAGAAAAACCCATACGAATCTAAATATCCGAAATGGAGAACAAATTAGTCATATACCCTAAAACAAAGACTAAGGGTGTGTTTGGTATGA
AAAATAATATTTTCCATGGGAAAATGTTCGGTTTCTTACTTATTTTCTTTTATTATGTACACAAATAAAAAGTGTCATTCTTGATACATTTTTATATAAT
CTAAACAAATACTGCGAGAGGTGGTGGCGAACTTAAGGTGTGTAGGAAGATCGAGAGAAAACAATCAACGTGGAATGTCGTCACAACTTGTTTTCCCTAC
TTCCACTGGCTAAGTCATTTTTAAAAAACTTACTTTCATAGAAAAAAGTATTTTCCCAGAATTTAGATCAACCAAACATGAAAAAATTCAGAAAAAATAA
ATAAATCAAACACGCCCTAAAAAACTCATAAAAGGTCCAAAATGTGTGCTTTGTACCTTTGTTTTCAAGGATCTGTTGATTTCAAGAAGAGATTGTTCCT
GTAGAAAAAAAGAAAAAAGAACACATACAATGTCAAATTAACAATTGAACAATCTATTTAATTGTCAACTTAAGGGATTATATTATACAATACATACCTT
TTGTTGAAGATCAGAAAGTTGATCAAGCATGTTTTGTGTCTGAAAACATATATGTTATCAAAGAGTAGGTTAACAACTTCTTTTACCAAATCATGCAACC
AACTATTTACCCTTTAATTATTTATAATTAGCATGTAAGTTGATGTTAGTAATAAAAGAGAAAGTAAATTTGTGTATGTTTTTGATACATGTTTACTTAG
GATAAATAATACAAAAGTTACAATAATACACTTACTTGGTAATCTTGACTTACCTTTAGTTTAAAAAAAATATATTTTCAATTTCAATTTTTTTGATCGT
TCCTATTGTTTCCTTTGATTAGTCATCTCGTGCATCTATATCTTTGATTGCATGTCTAGACTTTATGTCTGTACCCAAAAATATTAAGGAGGCTTTGATC
ATTCTGAAGCAATGCTTGAGTAAATTCATGCCAAAGATTATAATGAATTATGTAAAATAAAAGAACTTATTTTAAGGTTTAGTAGTTTTGTGGCACTATC
AAGTAATAGTAAGTAATTGTTATTATATTATTCCATTTGGATATTATTCATAAGTAATTTTTATCATTTTCCCAACATACCTTTGATAAAATTATATATT
ACACCAAATAGGGCAAAATTAAGTGTTTTTTATATATATATAAATTGTTGAACCCCGTTGATACGAGGTTAGATATTAGTGTATTTGTAAAGAGGTTCAA
TGTCTCAAGTTCAAATTTCAAGTCTGACATTCTATAATATATAATATTGCTTGAATTGTCTTGCATAAATTTCTAATTCCGCCACTGAAACTGTCATCGG
ACATTAAGATTAAGACATGATCTGAAAGCCTAAAATTTGACAAATAAATTGAAGGTGCATAGAACATACCCTTCTTGATCTTATTAGCCTCAAAGATGAA
TCCAGTTGACGCTCAAGCTGTTCCAAATCTTTTGTGTTTAATTGTCCTAAGTCCTCTCCAAGTATATGCCTTAAAGATTAAGAATAATTAAGTAAATACA
ATGTTATTAAGAATTAGGGTAGAAAAGTGATATATTTGAGACACAAATATCATATTAAAAAGCCTCCCCTTAATTTATTTTACGAGGTCTCATCTAAACA
TCCTGAACCTGATCAAACAAACGCATGATTGAACATGTCCAATTATGCATGTTCAAAATACTTCTAGACCGGTTCAGGTGTTCAGATGAGCCAATCAAAA
TGAGACAAGTAAAAGTGTTTTTAAAACAAATAATGTATCACCTTTGTGACTGTTGTAGCACTTCAACTCTTGCTTTCAGCTTCATATACTCTTGGTAGTT
ATTCTATTGCATAATAACACTAATTAGTTAGATGAAGATAGGGTGCTTGGCGTTAGTTATCAATATCGACTTATTAATTATTTACGAAGAAATTAAAATA
AAAACAGATAATCTGTTATAAAAGGTTTAAATTGCATCGATACTGTGTCAGAGTATATAAGTTAAATTTATTAGTAAATTGTAATTCTGAGGAAGATGAA
GTAACCTGTGAATCCTTTGAAGACTGGCCAGTTTCAAGGTCACCATAGCTGCATCTATGGTATCTCTCCAGTGTATCAGACATACTAGAAGAAAAAAAAG
AAGACAAGTTGCACAAAAGTGATAATTTGATTTAGAGGGATTTTCAACTTATTAAAGGATCATACTTTATTTACTCTTTGGCAAGAAGTGTAATTATTAC
TAGTTTTTTTAGCATGTTACAAAGTATAATAATAATAGTAACATTTCAGTATAATCTCATAAGTGGGGTTTGAGAAGAATGGAATATACGTAAACTTTAT
TTCTATCTCGTGAGAAGTTGTTTTTGATAGACTCTTTCAGCTTATGAAAAACAATTTCAAAACTAGGTTTAGCCAATACAAGAGTAAAAACTATGATAAA
AATACGATAGACAAAAAATTAAAGTCCATGAAGTAAAAATAGTACAGACAATCCAAGTAAAAGAAACAACAGTAATAATAAAATAAACATAGAGATAATA
ATAATAATGATATTGATAATAATTAGAACTATGCTCTCCTTGAGGAAAGAAAGAAAGAAAATTGTTTAAATAAAATTAGTTATAAGTTTCAATGTCATTT
ATTATTAACAAAAAAATTGTATACTTGATCCAAATAAAAAAATCAAGTTTAAGCATATTGAAAATGTTTAGATTACAAATATCGAGTAATAAGTATACGC
TACTATGATAACTCATTAATATTAAACTATTGATTTACTCATTAGTTAATATTCTTTAATTATAATTATCCAATAAATGACTTGATAGTATAAAAAAAAC
ACTATATTGTCAATGCATAGAGGTTACATAAACCAATATTATTTCTACTAAGTTATTTGATCTTGATTATGCTTTCTTAAAATTGTTAATTATTATAACT
TAAAATACTTCTTATACATGATTGAAATTATAAACAAAAATTGATTCGTAAAACTCGAATCACATAAATTATAACAGATAAGAGTAAATGACAAAATTTG
TCGGTTCAAGAACATTACTATCAAAATTAGATGAAAGGCAAGACCCTAACTTTAAGAAAAAGACGATTTAGATGGTCACTCAATTAATAAGTTTGTTATT
TAAAAAAATTAATATTATTTTTTAATTTCAATATAATTTTTTGGGATAATGATTATTAATTAAATAATTTTTTAAATAGAATTGATCAACTCCAGAAATT
ACTTCAATCCACAATACAGAATTTTCTATATAAATTGAGCTTAAATGAAAAGTTAAAGGATTCATATCGTCAATTCCGACTCGATAAGTAGTTAGGTGTT
ATTTGTTGCCATAAATAATAAAATCAAATTCCTTTTCAAAGTTTTTAGTTGTTTTCAAAAACTGAAGATAGAAATTCAACCAGCTTTAATTCAATTCATA
TTATAAAACTTCTTTTTGATTCATGTGTCTGTACTTAAAAGAACATATAAAAGTAAGGATATTTTAAAACTTATTTATTTATAATAAAAATAAGAAAAAA
TGGAGGTGGAACATCAAATCATAACAAAATTTACCTCATAAAATGAACTAATTTTTTTAACAATTTTAATGTTCAAGAAAACCTAGATCTAATCAAATGA
AACATTTGATTATTCACCCTTAATAAATGTACCAAAAACTCTATTCTCACTCAGATCTATAACATCAATATATTTTATTTCTTTTTTTAAAAAAAAAGAA
GATAACAAAATCATAATGCATATAAACATTCGTTTAACCATAGATTTTGAAATTAAATCTCAAAATTTCAATTTTTTAATACATTTAGAACTAATTTAAA
GTTTTGCGTATAAAAACGTAAATGTAAAGCTTAAACGGAACGACATAAACATAAAAATATTACCTAGAGGTACTGCAAAATTCATAGAGTTTGCCTCTAT
TAGAGAAAATGATAAGAGCAACTTCAGCTTCACACAAAATAGAAAGCTCATAAGCTTTTTTGAGTAATCCATTTCTTCTCTTAGCAAAAGTAACTTGCCT
GTTTATCTTATTTTCTATTCTCTTCAATTCTACCTTACCTCTTCCCAT
The mutation and phenotype for selected feature: Solyc04g005320
Project Name:Regulators of flowering and inflorescence architecture in tomato
CRISPR mutagenesis of candidate genes involved in flowering and inflorescence architecture in tomato...... Lab: LIPPMAN LAB, Cold Spring Harbor Laboratory; Contact: Zachary Lippman: lippman@cshl.edu| Transformation | Genetic background | Construct | gRNA | Plant | Mutation | Phenotype |
|---|---|---|---|---|---|---|
| M82_CR-LIN | M82 | CR-LIN | LIN-sgRNA-1 | CR-LIN M82-1 (F2 ) | homozygous (535 bp insertion) | |
| M82_CR-LIN | M82 | CR-LIN | LIN-sgRNA-2 | CR-LIN M82-1 (F2 ) | homozygous (535 bp insertion) | |
| M82_CR-SEP4s | M82 | CR-SEP4s | LIN/J2/EJ2-sgRNA-1 | CR-SEP4s M82-1 (T1 ) | chimeric | |
| M82_CR-SEP4s | M82 | CR-SEP4s | LIN/J2/EJ2-sgRNA-2 | CR-SEP4s M82-1 (T1 ) | chimeric |
This database is supported by NSF (IOS-1546625) and hosted by BTI.
